Anotando un par de sumas:
$$1,3,6,7,9,12,13,15,18,\dots$$
y comparándolo con la secuencia $$1,3,5,7,9\cdots$$
te da una pista de que la diferencia entre la secuencia aritmética y la secuencia que quieres describir es simplemente $$0,0,1,0,0,1,0,0,1,0,0,1\dots$$ que es una secuencia que se puede describir de forma cerrada de manera similar a $a_n$ .
Es decir, se puede ver que $$\sum_{i=n}^k a_n = 2k-1 + b_k$$
donde $b_k$ es igual a $1$ si $k$ es divisible por $3$ y $0$ de lo contrario.
Puedes expresar $b_n$ algebraicamente tomando $a_n$ y cualquier función para la que $f(1)=f(2)=0$ y $f(3)=1$ y tienes $b_n=f(a_n)$ .
No se me ocurre ninguna función "elegante" $f$ por el momento, pero un polinomio cuadrático seguramente puede hacerlo, ya que sólo tenemos una restricción en tres puntos. El polinomio cuadrático que satisface $f(1)=f(2)=0$ y $f(3)=1$ es $$f(x)=\frac12x^2-\frac32 x + 1.$$
Editar :
Gracias a BarryCipra, una función más agradable (más en el espíritu de su solución) para $b_k$ es
$$b_k = \left\lfloor 1 + \left\lfloor\frac k3\right\rfloor - \frac k3\right\rfloor$$